phenotypic and genotypic study of pseudomonas fluorescens strains pgu0 and assessment of its biocontrol against rhizoctonia solani, the causal agent of bean damping- off

[ ' f l u o r e s c e n t p s e u d o m o n a d s p r o d u c i n g 2 ' , 4 , ' d i a c e t y l p h l o r o g l u c i n o l ( d a p g ) a n t i b i o t i c h a v e b e e n w e l l s t u d i e d f o r u s e a s b i o c o n t r o l a g e n t s a r o u n d t h e w o r l d . p s e u d o m o n a s f l u o r e s c e n s p g u 0 s t r a i n w a s i s o l a t e d f r o m t h e r h i z o s p h e r e o f s u n f l o w e r i n b u s h e h r p r o v i n c e . d u a l c u l t u r e t e s t s h o w e d t h a t t h e s t r a i n h a d a n t a g o n i s t i c a c t i v i t y a g a i n s t r h i z o c t o n i a s o l a n i f u n g u s o n d i f f e r e n t m e d i a c u l t u r e s ; m o r e o v e r ' , ' u n d e r g r o w t h c h a m b e r c o n d i t i o n ' , ' t h e s t r a i n r e d u c e d d i s e a s e s e v e r i t y b y 5 2 % a n d c a u s e d a n i n c r e a s e i n d r y w e i g h t o f i n f e c t e d b e a n s e e d l i n g s b y 8 0 % . t h e p o l y m e r a s e c h a i n r e a c t i o n ( p c r ) u s i n g s p e c i f i c p r i m e r s ' , ' d e m o n s t r a t e d t h e p r e s e n c e o f k e y g e n e s ( p h l d ' , ' h c n b c a n d p l t b ) i n v o l v e d i n t h e b i o s y n t h e s i s o f a n t i m i c r o b i a l m e t a b o l i t e s p h l ' , ' p y o l u t e o r i n ( p l t ) a n d h y d r o g e n c y a n i d e ( h c n ) ' , ' r e s p e c t i v e l y . a n t i b i o t i c p r o d u c t i o n w a s e x a m i n e d b y h i g h ' , ' p e r f o r m a n c e l i q u i d c h r o m a t o g r a p h y ( h p l c ) a n d i t w a s f o u n d t h a t t h e s e b a c t e r i a a r e c a p a b l e o f p r o d u c i n g d a p g a n d p l t a n t i b i o t i c s . o n t h e o t h e r h a n d ' , ' p r o d u c t i o n o f h y d r o g e n c y a n i d e a n d s i d e r o p h o r e b y t h e b a c t e r i u m w a s d e m o n s t r a t e d u n d e r l a b c o n d i t i o n s . p h y l o g e n e t i c a n a l y s i s o f 1 6 s r d n a p r o v e d s i m i l a r i t y o f t h i s s t r a i n w i t h o t h e r w o r l d b i o c o n t r o l s t r a i n s c a p a b l e o f p r o d u c i n g a n t i m i c r o b i a l m e t a b o l i t e s l i k e p h l a n d p l t . ' ]